Peneliti Menggunakan Superkomputer untuk Menghitung Data Genetik tentang Cara COVID-19 Menyerang Tubuh Manusia
Superkomputer The Summit - salah satu komputer paling kuat di dunia - memungkinkan para ilmuwan menganalisis lebih dari 40.000 gen dari 17.000 sampel yang terkait dengan novel coronavirus COVID-19 dan mengembangkan hipotesis baru tentang bagaimana penyakit menular itu menyebabkan berbagai gejala pada tubuh manusia.
"Ini adalah salah satu waktu langka di mana Anda benar-benar dapat mengikat semuanya kembali ke momen eureka," kata pemimpin studi Dan Jacobson, dari Laboratorium Nasional Oak Ridge (ORNL) Departemen Energi AS di Tennessee, dalam rilis berita.
“Saya sedang melihat data, dan tiba-tiba saya melihat beberapa pola yang sangat berbeda terjadi di jalur sistem renin-angiotensin dan bradikinin. Hal itu membuat kami menyelami lebih dalam keluarga gen dari sistem pengaturan tekanan darah."
Pelepasan tersebut menggambarkan fenomena yang disebut badai sitokin: reaksi parah yang terjadi ketika tubuh manusia memproduksi lebih banyak sitokin, "berbagai protein kecil yang membantu mengatur sistem kekebalan" daripada yang diperlukan.
Badai sitokin disalahkan atas tingkat kematian yang lebih tinggi secara misterius yang terlihat pada beberapa penyakit, seperti influenza, di antara orang-orang muda dengan sistem kekebalan yang lebih kuat, yang secara efektif bereaksi berlebihan terhadap penyakit tersebut.
Penelitian awal COVID-19 dilakukan untuk menentukan apakah badai sitokin ini menyebabkan berbagai gejala yang lazim pada penderita COVID-19, termasuk hilangnya penciuman, lesi kulit yang dikenal sebagai "jari kaki COVID" dan kerusakan jantung.
Namun, Jacobson percaya ini terkait dengan jalur bradikinin, bersama dengan sistem renin-angiotensin, "mengatur tekanan darah dan keseimbangan cairan dalam tubuh" dan benar-benar dapat membantu menjelaskan berbagai cara di mana virus corona menyerang tubuh manusia.
"Kami percaya bahwa ketika Anda menghilangkan penghambatan di bagian atas jalur ini, Anda akan berakhir dengan aliran yang tidak terkendali yang mengarah ke pembukaan pembuluh darah dan menyebabkannya bocor," kata Jacobson. “Jika itu terjadi di paru-paru, itu tidak baik. Sel kekebalan yang biasanya terkandung dalam pembuluh darah membanjiri jaringan yang terinfeksi di sekitarnya, menyebabkan peradangan. "
"Jacobson dan rekan-rekannya membutuhkan kekuatan Summit untuk menjalankan 2,5 miliar kalkulasi korelasi yang membantu mereka memahami sirkuit regulasi normal dan hubungan gen yang diinginkan," menurut rilis berita.
Hasilnya, yang diterbitkan dalam jurnal ilmiah akses terbuka yang ditinjau oleh rekan sejawat, eLife, mengungkapkan bahwa gen yang terkait dengan sistem bradikinin "tampaknya terlalu 'dihidupkan' dalam sel cairan paru-paru orang yang terkena virus," menurut rilis berita tersebut.
Jika hipotesis Jacobson dan rekan-rekannya terbukti benar, maka setidaknya 10 obat yang ada dapat digunakan untuk mengobati jalur yang terganggu oleh penyakit menular, “tetapi uji klinis skala besar diperlukan untuk menentukan apakah mereka mungkin efektif dalam mengobati COVID-19,”sumber rilis tersebut.
- Source : sputniknews.com
